1、定義不同

羥基：是一種常見的極性基團(tuán)。羥基主要分為醇羥基，酚羥基等。

羧基：是有機(jī)化學(xué)中的基本化學(xué)基，所有的含有羧基的有機(jī)酸物質(zhì)都可以叫羧酸，由一個碳原子、兩個氧原子和一個氫原子組成。

2、化學(xué)式不同

羥基：化學(xué)式-OH，羥基與水有某些相似的性質(zhì)，羥基是典型的極性基團(tuán)，與水可形成氫鍵，在無機(jī)化合物水溶液中以帶負(fù)電荷的離子形式存在（OH-），稱為氫氧根。

羧基：化學(xué)式-COOH，如醋酸（CH3-COOH）、氨基酸都含有羧基，這些羧基與烴基直接連接的化合物，叫作羧酸。

3、保護(hù)方法不同

羥基：羥基是有機(jī)化學(xué)中最常見的官能團(tuán)之一，無論是醇羥基還是酚羥基均容易被多種氧化劑所氧化。因此在多官能團(tuán)化合物的合成過程中，羥基或者部分羥基需要先被保護(hù)，阻止它參與反應(yīng)，在適當(dāng)?shù)牟襟E中再被轉(zhuǎn)化。

羧基：酯化法保護(hù)羧基，甲酯和乙酯作為羧酸的保護(hù)基對一系列合成操作十分適用。

酯化法保護(hù)羧基，叔丁酯不能氫解，在常規(guī)條件下也不被氨解及堿催化水解，但叔丁基在溫和的酸性條件下可以異丁烯的形式裂去。此性質(zhì)使叔丁基在那些不能進(jìn)行堿皂化的情況下特別吸引人。